Java版合成系统
2×2合成网格
3×3合成网格(工作台上)
对于一些物品的合成，其原材料的排放位置无关紧要。这些配方通常称为“无序配方”。譬如，发酵蛛眼的合成配方就是无序配方，其原材料可以随意放置在合成方格中。
但是，许多重要的配方要求原材料以一定规律排列。不过，在原材料之间的位置保持不变的情况下，原材料排列的整体可以在合成方格内随意移动。例如，一个3×1的配方，如面包配方，其原材料，三个小麦，可以排在3×3合成方格的最顶行，中间行，或最底行，但却不能在2×2合成方格中合成，因为这种方格不能提供三个小麦横排的位置。这种“有序配方”的位置除了可以平移外，甚至还可以翻转：弓的配方中，作为“弓弦”的三条竖直排列的线，既可以放在左侧，也可以放在右侧。
玩家任何情况下都可以通过打开物品栏使用到2×2的合成方格。在这个合成方格中可以合成长宽都不超过2的配方，其中包括木板、木棍和最重要的工作台。要使用3×3的合成方格，则需要将工作台放在合适的位置，然后使用。此时会弹出一个3×3的合成方格，足够实现游戏里的所有配方
